El Consejo de Autoridades  como estructura organizacional del pueblo wounaan  tiene su propia estructura orgánica, un congreso, Asamblea, y un consejo que compone de consejeros  de forma piramidal la cual se compone de un consejero Mayor, un consejero de educación, un consejero de territorio y medio ambiente, un consejero de derechos humanos, un consejero en comunicación, una consejera de mujer e infancia y jóvenes, un consejero de salud y medicina tradicional, un consejero de planeación y finanza, según mandato del congreso del pueblo wounaan los consejeros son elegido por medio de votación secreta, y, estos delegados a estos cargos son propuesto por  cada zona en las asamblea de cada asociaciones y cabildos de las comunidades de los resguardos del pueblo wounaan, de esta forma los elegidos para los cargos se comprometen a trabajar por los intereses del pueblo wounaan haciendo el juramento ante el congreso quien lo eligió, luego de manera interna el  consejo de Autoridades para ejercer de sus cargos se construye,  un reglamento interno, quien servirá para medir las disciplinas en todos los sentido como líderes del pueblo wounaan, es así en el reglamento se tendrá en cuenta las siguientes.  1.responsabilidad,2.honestidad,3.seriedad,4.hermandad,5.pulcro,6.colaborador entre compañerismo,7.fraterno,8.democrático,9.sencillez,,10.Dinámica,11.comprometido por las causa del pueblo,12. tener sentido de pertenencia, 13.relaciones humanas, 14.realista,15. igualdad o equitativo entre consejeros, este se interpretaría, como muestra de buenos ejemplos y bueno modales ante las comunidades de cada resguardos, y, para, el cumplimiento de todos esto aquí se constituye el siguiente reglamento interno del consejo de autoridades de woundeko.